Colletotrichum und andere Schadpilze des Holunders in der Steiermark

Als Teil eines Forschungsprojekts über die Pilzkrankheiten Doldenwelke und Fruchtfäule, die hohe Ernteverluste in Kulturen des Schwarzen Holunders in der Steiermark verursachen, entstand diese Arbeit, in der das Augenmerk auf die Pathogenität der endophytischen Pilzgattung Colletotrichum und dessen Zusammenhang mit Pflanzenschutz und Wetter liegt. Zwischen Juni und September 2010 wurden an fünf Betrieben zwischen Ost- und Weststeiermark 650 Holunderproben aus Früchten, Blättern und Doldenstielen sowohl von unbehandelten als auch von mit Pflanzenschutzmitteln behandelten Bäumen entnommen und in einem Betrieb eine Wetterstation aufgestellt. Die Pilze wurden aus den Pflanzenproben isoliert, indem das Pflanzengewebe oberflächensterilisiert und zerkleinert auf Pilz-Nährmedium ausgebracht wurde. Die daraus entstandenen Pilzkolonien wurden in Reinkulturen übertragen, aus deren ribosomalen DNA über Polymerase-Kettenreaktion (PCR) der Internal Transcribed Spacer (ITS) vervielfältigt wurde. Durch Cycle Sequencing wurden die Sequenzen am Landeskrankenhaus Graz ermittelt. Die meisten Sequenzen konnten durch Vergleich mit der Datenbank des NCBI (National Center for Biotechnology Information) einem Pilztaxon zugeordnet werden. Infrage kommende Proben von Colletotrichum wurden durch Alignment mit verschiedenen Referenzsequenzen verglichen. Das Pilzaufkommen stieg im Laufe der Saison und besonders nach Regenperioden. Colletotrichum konnte 63 Mal nachgewiesen werden (16 % aller phytopathogenen Pilzproben), mit deutlicher Häufung am Ende der Saison. Es konnten drei Gruppen von Colletotrichum charakterisiert werden, die sich sowohl auf die Betriebe als auch auf die Pflanzenorgane unterschiedlich verteilten. Colletotrichum scheint zumindest nicht alleine an den Ernteausfällen beteiligt zu sein, da sein Auftreten schlecht mit den Erntemeldungen korreliert und durch Pflanzenschutzmittel nahezu vollständig unterbunden werden konnte.This paper is part of a research project about the fungal plant diseases ‘corymb wilt and ‘fruit rot, which are responsible for substantial yield loss in elderberry cultures in the region of Styria, Austria. The focus lies on the pathogenicity of endophytic fungi of the genus Colletotrichum and their interrelations with pesticides and weather. Between June and September 2010, 650 specimens were taken from leaves, fruits and corymb stalks from untreated as well as pesticide treated trees at five different elder farms between eastern and western Styria. A weather station was set up at one of the plantations. The fungi were isolated from the specimens by surface sterilizing the plant material, cutting it into small pieces and placing it on fungal culture medium. The fungal colonies were isolated into pure cultures, from which the Internal Transcribed Spacer (ITS) of the ribosomal DNA was amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR). The Sequences were determined by Cycle Sequencing at the Graz Regional Hospital (LKH) and could be associated with a fungal taxon by querying the NCBI (National Center for Biotechnology Information) database. Relevant Colletotrichum samples were compared to reference sequences by sequence alignment. The occurrence of endophytic fungi increased as the season advanced, particularly after rain periods. Colletotrichum was found in 63 samples (16 % of all phytopathogenic fungal specimens) with a significant culmination at the end of the season. Three taxonomic groups of Colletotrichum could be distinguished, which distributed differently between the farms as well as the different parts of the trees. Colletotrichum does not seem to be, if at all, a major responsible factor for elderberry yield loss, as its occurrence does not correlate well with the harvest statistics and the fungi could almost be totally eliminated by current pesticide treatment.Zsfassung dt. u. engl. SpracheGraz, Univ., Masterarb., 2013(VLID)258135