Correlation of antibiotic therapy with microbiological cultures and respiratory function tests in patients with cystic fibrosis

Trabalho Final do Mestrado Integrado em Medicina apresentado à Faculdade de MedicinaIntroduction: Cystic Fibrosis is a recessive autossomic disease. The most frequent related mutation is F508del. In Portugal there are an estimated 338 patients. The average age of adult patients in the outpatient clinic is 31.23 years old. The lung is the main organ that conditions morbidity and mortality. Its gradual function loss is aggravated by multiple factors such as colonizing agents, frequent exacerbations, other organs involvement and Diabetes mellitus. The aim of this study is to correlate the cycles of antibiotic therapy with current microbiology status and lung function. In addition, a demographic characterization of the adult patient population of the Centre of Portugal was carried out. Methods: In this five-year retrospective study we included adult patients from the CF outpatient clinic of Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra. Every patient was over 18 years old and transplanted ones were excluded. Demographic data, mutational profile, best annual lung function measurement and its corresponding weight, annual cumulative microbiology, number of intravenous and oral antibiotic cycles and associated comorbidities of every patient were assessed. BMI was also calculated. The statistical analysis included quantitative variable normality tests and correlation tests between LF, microbiology and number of antibiotic cycles. Results: 55.2% of the 29 registered patients were female, median age was 31.6±11.8 years and median height was 1.64 m. 86.20% of the 29 patients had at least one F508del mutation and 37.93% were F508del homozygotes. The second most common mutation was R3334W. 7% of the patients were underweight, 66% were normal weight, 21% were over-weight and 7% were obese. The most common microbiological agent found was Staphylococcus aureus. The highest number of antibiotic oral and intravenous cycles was 7. 75.9% of the patients had pancreatic insufficiency and 13.8% had Diabetes mellitus. A positive correlation was found between antibiotic intravenous cycles and presence of Rothia mucilaginosa in secretions; antibiotic intravenous cycles and presence of Burkholderia cepacia in secretions. There was a negative correlation between LF and presence of Pseudomonas aeruginosa in secretions. No other correlations between variables were found. Discussion: There was an increase in the number of patients with F508del mutation and with pancreatic insufficiency, still there was a decrease in the number of underweight patients. The presence of Rothia mucilaginosa, Burkholderia cepacia and Pseudomonas aeruginosa in secretions leads to a poorer prognosis. More studies are needed to clarify the role of multiple colonizing agents in CF.Introdução: A Fibrose Quística é uma doença autossómica recessiva sendo a mutação mais frequentemente envolvida a F508del. Estima-se que em Portugal existam 338 doentes. A média de idade dos doentes adultos seguidos na consulta do Centro Hospitalar de Coimbra é de 31,3 anos. O órgão maioritariamente responsável pela morbimortalidade é o pulmão, sendo o seu declínio funcional agravado por vários fatores, nomeadamente agentes colonizadores, exacerbações frequentes, atingimento de outros órgãos e Diabetes mellitus. Este estudo tem como objetivo correlacionar a antibioterapia com a microbiologia e a Função Pulmonar. Adicionalmente, pretende-se realizar uma caracterização demográfica dos doentes adultos da região Centro seguidos em Consulta de Adultos de FQ. Materiais e Métodos: Foi efetuado um estudo retrospetivo de cinco anos abrangendo os doentes seguidos no Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra com idade superior a 18 anos, excluindo os doentes transplantados. Foram recolhidos dados demográficos, perfil genético, melhor valor de função pulmonar de cada ano e peso correspondente, microrganismos identificados na expetoração, número anual de ciclos de antibioterapia oral e intravenosa e comorbilidades presentes; foi calculado o IMC e realizada uma análise estatística, testando a normalidade das variáveis quantitativas e a existência de correlação entre FP, microbiologia e ciclos de antibioterapia. Resultados: Dos 29 doentes registados, 55,2% eram do sexo feminino, a média de idades era de 31,6±11,8 anos e a altura média de 1,64 metros. 86,20% dos 29 doentes tinham uma mutação F508del, sendo 37,93% da população homozigota para esta mutação. A segunda mutação mais frequente foi R3334W. 7% dos 29 doentes tinham baixo peso, 66% peso normal, 21% excesso de peso e 7% obesidade. O agente microbiológico mais prevalente foi Staphylococcus aureus. O número máximo de ciclos de antibioterapia oral e intravenosa foi 7. 75,9% dos 29 doentes tinham insuficiência pancreática e 13,8 % Diabetes mellitus. Verificou-se uma correlação positiva entre ciclos de antibioterapia intravenosa e presença de Rothia mucilaginosa nas secreções e número de ciclos de antibioterapia intravenosa e presença de Burkholderia cepacia, e uma correlação negativa entre FP e presença de Pseudomonas aeruginosa. Não se verificaram mais correlações entre as variáveis estudadas. Discussão: Houve um aumento da prevalência da mutação F508del e da insuficiência pancreática, contudo houve uma diminuição dos casos de desnutrição. A presença de Rothia mucilaginosa, Burkholderia cepacia e Pseudomonas aeruginosa nas secreções traduz um pior prognóstico. São necessários mais estudos para esclarecer o papel de várias bactérias colonizadoras dos doentes com FQ