Pouvoir pathogène et diversité génétique chez Fusarium oxysporum f. sp. Vasinfectum (Atk) Sn. et H. : agent de la fusariose du cotonnnier

Une étude de la diversité génétique et du pouvoir pathogène a été réalisée sur une collection de 54 souches de Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum (FOV) de zones géographiques diverses afin de : a) déterminer la structure des populations de FOV aux plan génétique et du pouvoir pathogène ; b) rechercher l'existence de corrélations entre les données enregistrées à ces deux niveaux d'analyse, d'une part, et entre celles-ci et l'origine géographique des souches, d'autre part. Le but de cette seconde partie était d'identifier des marqueurs moléculaires permettant de caractériser les souches selon leur pouvoir pathogène et/ou leur origine géographique. La caractérisation du pouvoir pathogène a conduit à l'identification de trois races (A, B et C) au sein de la collection. Une corrélation a été établie entre ces races et leur distribution géographique. La diversité génétique a été étudiée au moyen de la compatibilité végétative, du polymorphisme isoenzymatique et du polymorphisme de l'ADN par la technique "RAPD". L'étude de la compatibilité végétative, a permis de répartir les souches de race A dans 8 groupes, celles de race B et de race C respectivement dans un seul GCV. Il en découle que, chez FOV, il n'existe pas de corrélation stricte entre les GCV et pouvoir pathogène. L'analyse isoenzymatique a généré un important polymorphisme entraînant une structuration très éclatée des souches de la collection. Cet outil s'est avéré peu performant tant pour l'analyse de la diversité que pour la recherche de caractères discriminants utilisables dans la pratique. L'analyse génomique par la technique des "RAPD" a permis de classer les souches en 4 groupes dont 3 correspondent, respectivement, aux races A, B et C; le quatrième groupe n'est représenté que par une souche qui s'est avérée non pathogène sur cotonnier. Il existe donc une corrélation nette entre "profils RAPD" et pouvoir pathogène ou origine géographique des souches conférant aux marqueurs RAPD un réel intérêt en tant qu'outil de caractérisation. Enfin des essais préliminaires indiquent que certains fragments d'ADN résultant de l'amplification pourraient servir de sondes pour la caractérisation des races de FOV. (Résumé d'auteur