Role of Erg subfamily of Ets transcription factors in mRNA splicing

The human family of Ets proteins and the Erg subfamily composed of 3 members (ERG, FLI1 and FEV) are known as transcription factors, involved in many cellular processes. On the other hand, most protein-coding genes contain intervening sequences (introns) that must be precisely removed from pre-mRNA through the process of pre-mRNA splicing. The first aim of this project was to molecularly characterise the link between these two actors. To achieve this goal, three different approaches were used. Firth, the link between the Erg subfamily and nuclear speckles, subnuclear structures that are enriched in pre-mRNA splicing factors, was studied using immunofluorescence and confocal microscopy, then an MS2-tethering assay was performed and finally, endogenous targets whose splicing would be dependent on this subfamily were identified. The results of these approaches highlighted interconnectivity between gene expression machineries. Moreover, such understanding of molecular basis of cancer-involved proteins provide new possibilities for earlier detection as well as better diagnosis, prevention and novel treatment strategies.Les facteurs Ets, et plus particulièrement les trois membres de la sous-famille Erg (ERG, FLI1 et FEV), sont reconnus comme des facteurs de transcription impliqués dans divers processus biologiques. L’épissage quant à lui est un processus au cours duquel les introns d’un ARN pré-messager sont éliminés, donnant un ARN messager mature. L’objectif principal de ce travail de fin d’études était de déterminer si un lien fonctionnel relie ces deux acteurs. Dans ce but, trois approches distinctes et complémentaires ont été exploitées : une étude du lien entre la sous-famille Erg et les nuclear speckles, des granules nucléaires impliqués dans le stockage, l’assemblage et la modification de facteurs d’épissage, par microscopie confocale à fluorescence, la mise au point et l’utilisation d’un essai rapporteur d’épissage par recrutement sur minigène SMN2-MS2 et l’identification de cibles d’épissage endogènes de cette sous-famille de protéines. La confirmation de ce lien a permis de participer à la construction d’un modèle intégré selon lequel la régulation de l’expression des gènes, notamment par les facteurs de transcription Erg, serait une combinaison de plusieurs mécanismes. De plus, une meilleure compréhension des rôles biologiques et des fonctions moléculaires des protéines, notamment de celles impliquées dans l’émergence ou le développement de cancers comme les facteurs Erg, permet d’aboutir à de nouvelles alternatives de diagnostic, de prévention, ou même de traitement de ces maladies