Suitability of RAPD analysis for the detection of somaclonal variants in oil palm (Elaeis guineensis Jacq)

Une analyse RAPD a été réalisée à l'aide d'amorces arbitraires de 10 nucléotides, dans le but d'étudier la conformité génétique de régénérants de palmier à huile (#Elaeis guineensis$ Jacq) issus d'embryogenèse somatique. Des palmiers régénérants présentant le phénotype "mantled" ont été identifiés au champ, et la capacité des marqueurs RAPD à mettre en évidence ces variants a été vérifiée. Sur les 387 amorces testées, 259 (67%) ont permis d'amplifier avec succès les fragments d'ADN génomique de palmier à huile avec des profils électrophorétiques répétables. Sur ces 387 amorces, 73 (19%) ont permis d'identifier un polymorphisme entre clones. A partir de ces 73 amorces, 24 ont été sélectionnées pour une expérimentation à plus grande échelle, destinée à comparer, dans un premier temps le génome des têtes de clone avec celui des régénérants clonaux qui en étaient issus, puis, dans un deuxième temps les régénérants normaux et variants. En criblant les 8900 marqueurs générés, nous n'avons pas pu identifier de variabilité intraclonale ni de différences entre tête de clone et régénérants. Il apparaît donc que le protocole de micropropagation clonale employé pour le palmier à huile, basé sur l'embryogenèse somatique, n'induit pas d'importants bouleversements génomiques. Nos résultats ont permis de montrer que l'approche RAPD n'est pas appropriée à la détection du phénotype variant "mantled". Dans cet article, l'emploi des marqueurs RAPD pour la mise en évidence des variations somaclonales chez le palmier à huile est discutée, et des approches moléculaires alternatives sont proposées. (Résumé d'auteur