Réseau BIOVEG, biotechnologies végétales et sécurité alimentaire, actions de recherche en réseau 2009-2010 : rapport scientifique annuel 2009

Dans le cadre des projets "Actions de Recherche en Réseau" financés par l'Agence Universitaire de la Francophonie, l'initiative SUDBIOTECH-Bénin a permis comme prévu; l'organisation en 2009: 1. d'une mission annuelle d'enseignement vers l'Université d'Abomey-Calavi à Cotonou. 2. d'un séjour de formation à DIAPC-Montpellier d'un Doctorant béninois. Du 6 au 11 juillet dernier, s'est tenu le "IIème Atelier sur la Biologie Moléculaire et les Biotechnologies Végétales" à l'Institut des Sciences Biomédicales Appliquées (ISBA) de la Faculté des Sciences et Techniques. L'Atelier a rassemblé 28 étudiants issus de huit nationalités différentes (Bénin, Togo, Centrafrique, Gabon, Congo, Cote d'Ivoire, Tchad et Nigeria) de niveau M2 et PhD en Sciences de la Plante ou Analyses Biomédicales. L'équipe pédagogique, composée de trois enseignants issus d'institutions françaises diverses offre des compétences scientifiques complémentaires: Alain RIVAL (DR Cirad Montpellier: Biologie Moléculaire, Epigénétique), Yves HENRY (DR CNRS- IBP Orsay: Génétique, Amélioration des Plantes) et Aimé NATO (MCCE Université Paris-XI: Biochimie, Biologie cellulaire). Elle a été renforcée par un apport considérable des Enseignants-chercheurs béninois de l'UAC: Ambaliou SANNI, Nicodème CHABI, Kifouli ADEOTI. En outre, les chercheurs de l'ADRAO-WARDA (M-Noëlle NDJIONDJOP et Nani DRAME) ont accueilli l'Atelier durant une demi-journée, proposant une visite détaillée et deux séminaires spécialisés, ouvrant ainsi les étudiants aux applications concrètes des notions évoquées lors de la formation. Au total, 50 heures de cours, TP et TD ont été dispensées. L'accent a été mis sur les expérimentations pratiques directement issues de travaux de recherche en cours, avec la réalisation de 4 séances de TP: TP1/Flexibilité Métabolique et Morphogénétique (Effet des effecteurs lumière et phytohormones sur la croissance et le développement, dosage de protéines, électrophorèses natives et dénaturantes, Western Blot), TP2/ Extraction des nucléotides végétaux (protocole simplifié à l'aide d'ingrédients simples: sel de cuisine et détergent domestique, visualisation de pelotes de nucléotides au BEt sous UV); TP3/Détection d'OGMs par PCR (formation a la PCR, électrophorèse, effet des conditions d'amplification); TP4/Production de protéines recombinantes par cultures in vitro (Détection par Western Blots, révélation par IgG secondaires marqués). Du 1er Octobre au 31 Décembre 2009, Mr Kifouli ADEOTI, Doctorant de l'Université d'Abomey Calavi a été accueilli au sein de la Plateforme GeneTrop de l'UMR DIAPC à Montpellier, France. Ce séjour vient compléter le travail de Thèse de Doctorat engagé sur le thème "Biosystématique et conservation de quatre légumes feuilles traditionnels consommés au Bénin: Ceratotheca sesamoides, Sesamum radiatum, Acmella uliginosa et Justicia tenella. Les récents travaux conduits sur l'écogéographie de ces quatre espèces a permis de constater qu'elle présente chacune des distributions assez variables à travers les différentes zones agro écologiques du Bénin. Dans le but de contribuer à la domestication de ces espèces de légumes, il est important que des paramètres agro-morphologiques et génétiques soient connus. A notre connaissance, il n'existait aucune étude sur la diversité génétique de ces espèces utilisant les marqueurs moléculaires et/ou la cytométrie en flux. C'est dans ce cadre que s'inscrit ce stage de formation, organisé dans le but de transférer à l'Universté d'Abomey-Calavi de nouvelles techniques d'étude en Biologie moléculaire et leur application sur les différentes espèces d'étude concernées par le travail de Thèse. Les objectifs poursuivis étaient: i) de déterminer le taux de ploïdie et la taille du génome des différents écotypes de chaque espèce, ii) La mise au point et l'optimisation de protocoles spécifiques d'extraction d'ADN iii) étudier la diversité génétique par l'utilisation des marqueurs moléculaires AFLP. L'obtention d'une bourse de la Wood