Etude de la prévalence et de la diversité des populations de virus de la mosaïque en tirets du bananier (BSV) et de virus X du bananier (BVX) en Guadeloupe

Afin de lutter contre de nombreux pathogènes et ravageurs des bananiers et des plantains, plusieurs programmes d'amélioration génétique menés dans le monde ont pour objectif de créer et de sélectionner des variétés hybrides inter-spécifiques résistantes, à partir de parents Musa acuminata (A) et Musa balbisiana (B). Cependant, certains hybrides interspécifiques naturels ou créés, de génotype AAB ou AAAB, développent la maladie de la mosaïque en tirets (BSD), en l'absence de contamination extérieure par le virus responsable, le Banana streak virus (BSV). Ces infections résultent vraisemblablement de l'activation de séquences virales BSV intégrées au génome Musa balbisiana et appelées endogenous pararetrovirus (EPRV). Certains EPRV pathogènes, dont des EPRV BSV, sont exprimés sous l'action de facteurs de stress biotiques ou abiotiques, comme les différences de température. Il existe donc un risque d'activation des EPRV BSV pathogènes à l'échelle de la parcelle pour les hybrides interspécifiques AAB ou AAAB. Afin d'évaluer ce risque, une étude de la prévalence et de l'impact des différentes espèces de BSV sur bananiers et plantains a été conduite pour la première fois en Guadeloupe. Une campagne d'échantillonnage et d'indexation de masse a été effectuée. Elle a montré que l'impact de la maladie est très faible, caractérisé par un nombre limité de foyers et l'absence de symptômes dans la quasi-totalité des cas. L'analyse des données recueillies semble indiquer que la présence du BSV en Guadeloupe pourrait résulter de l'expression d'EPRV BSV pathogènes plutôt que d'une transmission par vecteur. Au cours de ce travail, la prévalence et la diversité moléculaire du virus X du bananier ont également été étudiées. Les résultats obtenus montrent que le BVX présente un très faible niveau de prévalence en Guadeloupe et que sa présence ne peut être associée à aucun symptôme. Par ailleurs, cette étude a confirmé le très faible niveau de diversité moléculaire du BVX et a permis de valider à grande échelle une méthode de détection par PCR basée sur l'utilisation d'amorces spécifiques. (Résumé d'auteur