Recherche et étude des locus controlant les caractères à déterminisme génétique complexe (QTL) du palmier à huile (Elaeis guineensis Jacq.) par cartographie génétique multiparentale

Une recherche multiparentale de QTL agronomiques a été réalisée étape par étape chez le palmier à huile (E. guineensis Jacq.), de la production des marqueurs moléculaires à l'identification des QTL, en vue d'une amélioration génétique de la plante. Un nombre total de 390 marqueurs microsatellite (SSR) a été développé chez le palmier à huile. Le polymorphisme SSR a été caractérisé sur l'espèce E. guineensis, mais également chez l'espèce proche E. oleifera vers laquelle une transférabilité optimale des marqueurs a été observée, ainsi que chez 16 autres espèces de Palmae dont le cocotier (C. nucifera). Vingt-six caractères phénotypiques quantitatifs ont été étudiés au travers d'un plan de croisement de type factoriel complet 2 x 2 impliquant 4 parents issus de 3 fonds génétiques Deli, La Mé et Yangambi. Une carte génétique de référence a été élaborée sur un croisement LM2T x DA10D du plan factoriel, à l'aide de 944 locus (255 SSR, 688 AFLP, locus Sh) distribués sur 16 groupes de liaison correspondant aux 16 paires de chromosomes de la plante. Cette carte de 1735 cM a permis d'échantillonner 253 locus SSR à l'aide desquels une carte génétique consensus du plan factoriel a été construite. En outre, 2 marqueurs AFLP ont été identifiés à 7 cM et à 11 cM du gène Sh gouvernant le type variétal du fruit chez le palmier à huile, par une analyse de ségrégation en mélange et par cartographie génétique. Un ensemble de 71 QTL de caractères végétatifs et de production ont été identifiés sur le plan factoriel 2 x 2, par une analyse CIM à l'aide de 3 types de modèle linéaire additif de recherche de QTL, grâce à un logiciel pilote MCQTL Outbred mis au point par l'INRA (France) : modèles d'analyse croisement par croisement, multiparental déconnecté ou multiparental connecté. Une validation des QTL identifiés et une intégration de l'approche multiparentale sont proposées dans le cadre d'un schéma général de sélection assistée par marqueurs du palmier à huile dans le contexte du genre Elaeis. (Résumé d'auteur