Carte génétique du cacaoyer avec les marqueurs moléculaires

Différents types de marqueurs moléculaires ont été utilisés durant le projet pour réaliser des cartes génétiques des diverses descendances étudiées et localiser les QTLs. Afin d'obtenir un grand nombre de marqueurs disponibles pour comparer les cartes génétiques, on a essayé de produire et de cartographier des marqueurs micro-satellites sur la carte de référence. Ces marqueurs sont très polymorphes, co-dominants et ne nécessitent que peu d'ADN. Quatre différentes banques enrichies en micro-satellites ont été obtenues (86 % des clones contiennent un micro-satellite). Le laboratoire Biotrop fut assisté par le Centre National français de Séquençage dans l'établissement des séquences des fragments d'ADN nécessaires pour la production de marqueurs micro-satellites. 280 fragments ont été séquencés et 141 séquences uniques ont été isolées et sont exploitables pour l'isolement des micro-satellites. Jusqu'à présent 40 nouveaux micro-satellites polymorphes ont été isolés et 33 micro-satellites peuvent être cartographiés. 19 autres micro-satellites fournis par Nestlé peuvent être cartographiés sur la carte de référence. Maintenant, 69 micro-satellites sont cartographiés sur la carte de référence. (Résumé d'auteur