Capture-recapture

Une expérience de "capture-marquage-recapture" (CMR) suppose que l'animal capturé soit relâché après son marquage, qu'il retourne dans sa population d'origine et qu'on essaie ensuite de le recapturer. Les caractéristiques importantes des données recueillies sont qu'elles sont issues de suivi individuel en temps discret d'animaux vivants. L'analyse de ces données peut se faire avec des modèles CMR traditionnels. Les méthodes d'analyse diffèrent selon que l'étude porte sur la taille de la population ou non à cause de la sensibilité à l'hétérogénéité de capture. D'autre part, l'étude de l'effectif se fera par des échantillonnages rapprochés entre lesquels mortalité, naissances et mouvements de ou vers l'extérieur sont négligeables. On parle de modèles des populations fermées (estimation de la taille de la population) et de modèles des populations ouvertes où l'on estime respectivement les paramètres démographiques et des visées explicatives. Des logiciels généraux tels que GLIM permettent de faire des analyses de survie, de recrutement ou des analyses multisite