Determinación de coeficiente de endogamia de la población Holstein de Antioquia

En los hatos lecheros de Colombia, la endogamia se ha convertido en un aspecto importante por medio del cual se pierde la diversidad genética en los animales y o la heterocigocidad de los mismos, reflejándose en manifestación de numerosos problemas genotípicos y fenotípicos en el hato y aumentando la probabilidad de heredar a las siguientes generaciones alelos asociados a defectos genéticos, lo que se traduce finalmente en una reducción de la capacidad de adaptación de los animales al medio ambiente y un aumento en el riesgo de extinción. Razón por la cual se realizó la determinación del coeficiente de endogamia en una población lechera Holstein de Antioquia, mediante el uso de una base de datos de más de 7000 animales, completando su genealogía usando la base de datos dairy Bulls, para construir un pedigrí mediante el software pedigree viewer, adicionalmente se tomaron 160 animales genotipados con el chip BovineLD los cuales fueron usados para reconstruir la matriz G, y a partir de esto calcular la endogamia molecular. El análisis de los 20 toros mas usados, arrojó que 4 de estos compartían abuelo paterno. Es por esto, que es de gran importancia conocer y llevar un control de la endogamia para mantener variabilidad genética y así evitar los problemas que conlleva. Se encontró que la información genealógica fue muy incompleta en todos los casos, lo que hace que la endogamia sea subestimada por falta de información. La máxima endogamia por pedigrí fue de 0.026% y la matriz de relaciones genómicas permitió estimarla en 2.75%, valores muy diferentes entre sí. En general se concluye que la información genealógica de la región es pobre para estimar la verdadera endogamia de la población y en estos casos la información molecular es particularmente ventajosa