Estudio de la regulación transcripcional activada por el morfógeno Dpp durante la formación del ectodermo dorsal en Drosophila melanogaster

Tesis (Doctor en Biotecnología)En este proyecto, se diseñaron experimentos utilizando microarreglos que contienen el transcriptoma completo de O. melanogaster para identificar nuevos genes diana de la vía Dpp/pMad. Hemos medido los cambios de expresión entre muestras de ARNs extraídas de embriones silvestres y embriones con carencia y exceso de la función de Dpp. Paralelamente, se generó un mapa con las zonas que contienen grupos de motivos de unión de Mad como probables MRCs involucrados en los estadios tempranos del desarrollo de D. melanogaster. Estos resultados se integraron con datos de conservación de secuencias, siguiendo la huella filogenética y bases de datos de expresión in situ y logramos identificar los MRCs de tres genes (CG13653, CG12420 y CG8147) cuya expresión varía bajo las perturbaciones de la señal de Dpp. Finalmente, examinamos la funcionalidad in vivo de los MRCs en ensayos en líneas transgénicas con genes reporteros (/acZ).In this project, I designed experiments using microarrays containing the complete transcriptome of O. melanogaster to identify novel target genes downstream of Dpp/Mad pathway. We measured the change of expression among samples of RNAs extracted from wild type embryos and embryos with loss-of-function and gain-of-function of Dpp. In parallel, we generated a map with groups of Mad binding motifs to predict probable CMRs involved in the early development of O. melanogaster. These results were integrated with data from sequence conservation, following the phylogenetic footprinting and in situ expression databases. I identified three novel genes (CG13653, CG12420 and CG8147) whose expression varíes under perturbations Dpp signals and are expressed in the ED region . Finally, we examined the CRMs in vivo functionality assays in transgenic lines of flies with reporter genes (/acZ)