Tokaji aszúesszencia vizsgálata molekuláris biológiai és metagenomika módszerekkel

Aszúesszenciát elemeztünk,ehhez lecentrifugáltuk a mintákat,majd az üledéket és a felülúszó fázist használtuk további vizsgálatokra. Kétféle metódust hajtottunk végre: az egyiknél az üledékből YPA táptalajra szélesztettünk, az abból kinőtt telepekből pedig genomi DNS-t izoláltunk,ezután PCR-t végeztünk,a terméket elküldtük szekvenálásra ; a másik módszernél a felülúszót és az üledéket direkt PCR-nek vetettük alá.Az üledékből felszaporított PCR fragmentumokat klónoztuk,a telepekből pedig plazmidot izoláltunk. A pozitív klónokat szekvenálásra bocsátottuk. A szekvenciák kielemzése bioinformatikai módszerekkel történt. A metagenomikai analízishez az aszúesszenciából teljes genom amplifikációt hajtottunk végre. A mintát második generációs(Illumina Hiseq2000) szekvenálásra bocsátottuk.BSc/BAbiológiag