New methods for the chemical synthesis of ribonucleotides and their analogues : a thesis

Note:The synthesis of 5’-monomethoxytrityl-2'-tert-butyldimethylsilyl-3'-levulinylribonucleosides of the four common bases as well as their 2',3' isomeric derivatives was accomplished. These units are suitable for block condensations via the phosphite procedure as demonstrated in the preparation,in good yield, of a hexadecauridylic acid. A novel solid phase synthesis of ribonucleotides featuring the use of the phosphite procedure, along with a derivatized silica gel polymer, was fully investigated. The efficiency of the method is exemplified in the stepwise assembly of a nonadecamer corresponding to the dihydrouridine loop of t-RNAfMet. Several mild reagents capable of hydrolyzing nucleotides from the polymer were introduced. In addition, a new non-aqueous oxidation of phosphite triesters using meta-chloroperbenzoic acid was examined.The isolation and properties of oligonucleoside phosphites is reported and their use in nucleotide synthesis described. Versatile routes to several nucleotide analogues modified at the phosphate linkage are suggested. The interactions of novel analogues with various enzymes are analyzed. Using the phosphite procedure, symmetrically linked (5'-5', 3'-3', 2'-2') diribonucleoside monophosphates of uridine were easily prepared. The stability of these dimers to acid, base and enzyme hydrolysis is discussed. Finally, the use of the levulinyl moiety as a new N-acyl protecting group for nucleosides is proposed.On décrit la synthèse des monomethoxytrityl-5'-tert-butyldimethylsilyl-2' levulinyl-3' ribonucléosides des quatre bases communes ainsi que les dérives isomères 2',3'. Ces unités permettent la synthèse d'oligonucléotides par blocs suivant le précède de couplage au chlorophosphite. La méthode est illustrée par la préparation, en ban rendement, de l'acide hexadecauridylique. Une nouvelle synthèse de ribonucleotides en phase solide fut étudiée. Le support utilise est un gel de silice et le précède de phosphorylation est celui du chlorophosphite. On met en évidence l'efficacité de la méthode en préparant, par étape, le nonadecamere correspondant à la boucle dihydrouridine du t-RNAfMet. On introduit aussi plusieurs réactifs capables d'hydrolyser les nucléotides du polymère. De plus, on examine une nouvelle oxidation nonaqueuse des phosphites de trialkyles à l'aide de l'acide metachloroperbenzoique. On rapporte également l'isolement et les propriétés d'oligonucleoside phosphites ainsi que leur utilité pour la synthèse d'oligoribonucleotides. On suggère aussi des routes versatiles qui permettent !'obtention de nombreux analogues de nucléotides modifies au lien phosphate et on analyse !'interaction de ces molécules avec plusieurs enzymes. Les diribonucleosides monophosphates de l'uridine ayant un lien symétrique (5'-5', 3'-3', 2',2') furent facilement prépares grâce à la méthode de couplage au chlorophosphite. La stabilité de ces dimères quant a !'hydrolyse en milieu acide, basique et enzymatique fut aussi étudiée. Enfin, on propose !'utilisation du groupement levulinyle pour la protection de la fonction amine des nucléosides