Proteomics of complex systems

La proteòmica basada en espectrometria de masses és una tècnica analítica d’identificació i quantificació de proteïnes que, gràcies als avenços de les últimes dècades, es troba actualment en disposició de resoldre problemes complexos de la biologia molecular i de sistemes. Avui dia s’estan posant les bases per a la consolidació d’aquestes aplicacions i per desenvolupar-les de manera que la proteòmica tingui un impacte real en la medicina personalitzada del futur. Els nous desenvolupaments han fet augmentar significativament la sinergia entre la proteòmica i la biologia molecular, especialment en l’anàlisi de les xarxes de proteïnes i en dinàmiques temporals i espacials. Aquests estudis han permès aprofundir en l’elucidació de mecanismes d’acció i les seves disfuncions, la creació de models de resposta a tractaments, la identificació de biomarcadors per a la classificació i estratificació de pacients, i la concreció de l’impacte de la variabilitat genètica sobre els fenotips observats.Paraules clau: proteòmica, espectrometria de masses, biologia, medicina personalitzada.Mass spectrometry-based proteomics is an analytical technique for the identification and quantification of proteins which, thanks to advances in recent years, is now able to address complex problems in molecular biology and systems biology. Currently, efforts are being conducted to consolidate these applicating and to further develop in order for proteomics to have a real impact on the future of personalized medicine. New developments have significantly increased the synergy between proteomics and molecular biology, especially in the analysis of protein networks and their temporal and spatial dynamics. These studies have allowed the elucidation of certain mechanisms of action and their dysfunctions, the creation of models of response to treatment, the identification of biomarkers for patient stratification and classification, and the assessment of the impact of genetic variation on the observed phenotypes.Keywords: proteomics, mass spectrometry, biology, personalized medicine