Bacillus mycoides: novel tools for studying the mechanisms of its interaction with plants

Plantengroei bevorderende rhizobacteriën (PBR) is een groep bacteriën die de wortels van de plant koloniseren en de plantengroei kunnen bevorderen. Inzicht in de moleculaire mechanismen van hoe planten en PBR naast elkaar kunnen bestaan ​​en van elkaar kunnen profiteren, kan nieuwe strategieën bieden om de gezondheid en productiviteit van planten te verbeteren. Dit kan leiden to duurzame alternatieven voor klassieke bestrijdingsmiddelen. Bacillus mycoides is een bacterie die veel aanwezig is in gezonde aardappelwortels en een sterk groei bevorderend potentieel heeft voor planten. In dit onderzoek hebben we het moleculaire mechanisme van de B. mycoides-plant interacties onderzocht. Hiertoe werd een multidisciplinaire benadering toegepast en werden nieuwe moleculair genetische hulpmiddelen ontwikkeld. De vergelijkende genoom analyses onthulden dat er een vermeende endofytische clade is binnen de B. mycoides-soort. Fluorescente eiwitten werden gebruikt om een endofytische en een bodemstam te labelen. Hun wortelkolonisatiepatronen werden bestudeerd met behulp van een confocale laserscanningmicroscoop, waaruit bleek dat de endofytische stam een ​​beter vermogen tot wortelkolonisatie heeft dan de bodemstam. Uit de transcriptoomanalyse bleek dat de endofytische stam een ​​breder scala aan substraten in de rhizosfeer-nis kan gebruiken dan de bodemstam. Er werd ontdekt dat sideroforen geproduceerd door B. mycoides de groei van planten met een ijzertekort bevorderen en een belangrijke rol spelen bij de interactie tussen deze bacteriën en planten