Estimation of the PCR efficiency based on a size-dependent modelling of the amplification process

We propose a stochastic modelling of the PCR amplification process by a size-dependent branching process starting as a supercritical Bienaymé–Galton–Watson transient phase and then having a saturation near-critical size-dependent phase. This model based on the concept of saturation allows one to estimate the probability of replication of a DNA molecule at each cycle of a single PCR trajectory with a very good accuracy. To cite this article: N. Lalam et al., C. R. Acad. Sci. Paris, Ser. I 341 (2005). Nous proposons une modélisation stochastique du processus d'amplification par PCR s'appuyant sur un processus de branchement taille-dépendant qui débute par une phase transitoire de type Bienaymé–Galton–Watson supercritique et qui présente ensuite une phase de saturation taille-dépendante presque-critique. Cette modélisation basée sur le concept de saturation permet d'estimer la probabilité de réplication d'une molécule d'ADN à chaque cycle d'amplification à partir de l'observation d'une unique trajectoire d'amplification par PCR avec une très bonne précision. Pour citer cet article : N. Lalam et al., C. R. Acad. Sci. Paris, Ser. I 341 (2005)