Differentially expressed circular RNAs in human hepatocellular carcinoma

目的:探讨环状RNA (circRNA)在肝细胞癌(HCC)与正常肝组织中表达谱的差异.方法:利用circRNA芯片技术检测3例HCC组织和癌旁肝组织circRNA的表达谱,经过对原始数据进行预处理、均一化后,找出差异表达的circRNA(与癌旁肝组织比较,HCC组织中1.5倍以上变化并且差异有统计学意义的circRNA定义为差异表达的circRNA).根据表达差异倍数较高和样本间一致性较好的原则筛选circRNA,借助生物信息学软件预测可能受其调控的miRNA,结合文献检索初步确定可能在HCC中具有重要作用的circRNA.结果:与癌旁肝组织比较,HCC组织中的circRNA表达谱发生了明显变化.HCC组织中,1.5倍以上变化的circRNA共82条,其中上调21条,下调61条;5倍以上变化的circRNA共3条,其中上调2条,下调1条.最终筛选出在HCC组织中明显上调的hsa-circ-0043278(8.15倍,P=0.002)、hsacirc-0006220(12.73倍,P=0.033)和明显下调的hsa-circ-0065214(6.28倍,P=0.019);生物信息学分析和文献检索显示,hsa-miR-520可能受hsa-circ-0043278和hsa-circ-0006220调控而影响HCC的发生和进展.结论:HCC组织circRNA表达谱发生了显著变化;hsa-circ-0043278和hsa-circ-0006220可能在HCC的发生和进展中发挥重要作用.北京大学人民医院研究与发展基金资助项目中国科学引文数据库(CSCD)165-692