Caraterização molecular da biodiversidade de Vitis vinifera

Mestrado em Bioquímica ClínicA videira é uma das espécies frutíferas mais importantes a nível mundial. Dentro do género Vitis, a Vitis vinifera representa a espécie mais importante e mais utilizada para a produção de vinho, e apresenta muitas variedades, quer a nível de castas, quer ao nível dos clones. A sua grande variabilidade morfológica, metabólica e genética por um lado apresentam-se como uma vantagem, como um fator diferenciador, mas por outro lado dificulta a identificação de castas e clones de videira. Deste modo, a diferenciação inter e intra castas é de extrema importância para os vários agentes económico: o viveirista, o agricultor, as adegas a até consumidores, dado que a qualidade do vinho, entre outros fatores, depende da casta/clone utilizada. Desta forma, a identificação molecular de V. vinifera apresenta-se como uma ferramenta de extrema utilidade para a identificação inequívoca das videiras. Atualmente, esta é feita com microssatélites (SSRs). Neste trabalho procurou-se explorar o potencial dos Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) como marcadores moleculares. Para tal, selecionaram-se 32 regiões do genoma de V. vinifera que foram testados em 10 castas distintas, com 2 clones de cada casta. Neste trabalho, identificaram-se um total de 103 SNPs que permitem discriminar as castas estudadas, muito embora não tenham a capacidade de diferenciar os clones. Contudo, dos 103 SNPs, verificou-se que bastariam 12 SNPs para discriminar as 10 castas estudadas. Em conclusão, este estudo confirma o potencial de utilização dos SNPs como ferramenta moleculares para a discriminação de castas de V. vinifera.Grapevine is one of the world’s most important fruit species. Within the genus Vitis, Vitis vinifera is the species that represents the most important and used for the production of wine. This specie includes many varieties and clones. The morphological, metabolic and genetic variability on one hand appear as an advantage, as a differentiating factor, but on the other hand, it is difficult to identify varieties and clones of the grapevine. Thus, the differentiation within and between varieties is extremely important for various economic agents: the nursery, the farmer, the wineries and ultimately the consumers, since the quality of wine, among other factors, depends on the variety/clone used. Therefore, the molecular identification of V. vinifera is of utmost importance for the unequivocally identification of the grape varieties. Currently this is done with microsatellites (SSRs). In this study we investigate the potential of the Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) as molecular markers. For this purpose, we selected regions of the genome of 32 V. vinifera that were tested on 10 different varieties, 2 clones from each variety. In this study, we identified a total of 103 SNPs that allow us to discriminate the varieties studied, although it does not have the ability to differentiate clones. From the 103 SNPs that were identified, it was found that 12 of them were enough to discriminate all the 10 cultivars studied. In conclusion, this study confirms the potential use of SNPs as molecular tool for the discrimination of varieties of V. vinifera