Genotipificación, niveles de expresión y estado de integración del virus de papiloma humano en el carcinoma orofaríngeo de células escamosas

El cáncer escamocelular es uno de los tumores más frecuentes de cabeza y cuello, ocupa el quinto lugar entre todos los tipos de cáncer en el mundo, entre los factores de riesgo se encuentran el consumo de tabaco y alcohol y las infecciones virales como el Virus del Papiloma Humano (VPH), éste último principalmente para el carcinoma orofaríngeo de células escamosas, donde se considera como el principal factor de riesgo, ya que según datos epidemiológicos existen frecuencias de prevalencias que varían desde un 20% hasta en un 80% dependiendo de la región geográfica. En Colombia solo existe un estudio de cabeza y cuello asociado a VPH, realizado por Quintero y colaboradores en el 2013, donde se reportó una prevalencia de 18.9%. Por esta razón el presente estudio busco identificar los tipos virales de alto riesgo más frecuentes en una muestra de pacientes con cáncer orofaríngeo así como determinar los niveles de expresión y estado físico del genoma viral (integrado/ episomal) para el tipo de virus más prevalente. El presente estudio fue de tipo multicéntrico descriptivo donde se incluyeron 46 adultos que asistieron a los servicios de cirugía de cabeza y cuello en las ciudades de Bogotá, Manizales y Bucaramanga, previo consentimiento informado. Todas las muestras diagnosticadas histopatológicamente con carcinoma escamocelular de orofaringe fueron incluidas en este estudio. A las muestras se les realizo extracción de ADN y ARN, con el ADN se realizó genotipificación de VPH y se estableció el estado físico del genoma viral. Con el ARN se determinó el número de copias por PCR en tiempo real. La prevalencia de VPH fue de 21.74% de los tumores, El tipo viral más frecuente fue el VPH 16 (9 casos) y el VPH58 (1 caso). La expresión viral fue baja para VPH 16 (1-11 copias) y el estado físico predominante de este virus fue el mixto (8 casos), prevaleciendo la disrupción en el sitio de unión de E1 y E2 (nt 2525 a 3720).Squamous cell cancer is one of the most common tumors of the head and neck it ranks fifth among all cancers in the world. Among the risk factors are the consumption of tobacco and alcohol, and viral infections with Human Papillomavirus (HPV), and viral infections with Human Papillomavirus (HPV), the latter mainly for oropharyngeal squamous cell carcinoma (OSCC), for wich HPV is considered as the main risk factor, the latter mainly for oropharyngeal squamous cell carcinoma, which is considered as the main risk factor, because according to epidemiological data exist frequencies prevalences ranging from 20% to 80% depending on geographic region. In Colombia there is only one report of head and neck cancer associated with HPV, made by Quintero and collaborators in 2013. Therefore, this study was aimed at identifying the most prevalent high-risk HPV types in our OSCC patients as well as determining the expression levels and physical condition of the viral genome (episomal/integrated) for the most prevalent HPV type of virus. This was descriptive multicentric study which included,prior informed consent, 46 adults attending the of head and neck surgery services in the cities of Bogota, Manizales and Bucaramanga. All samples histopathologically diagnosed with oropharyngeal squamous cell carcinoma were included in this study. A sample was performed extraction of DNA and RNA. Genotyping of the HPV DNA and determination of its physical state was performed. The RNA samples were used to measure viral transcript copy number by real-time PCR. HPV prevalence was 21.74% (10 cases), the viral types found were HPV16 (9 cases) and VPH58 (1 case). Viral expression was low for HPV 16 (1- 11 copies) and the predominant physical state of this virus was mixed episomal and integrated (8 cases) with disruption of the site between the E1 and E2 genes (nt 2525 to 3720)