GALAMOST是一个多功能的分子动力学模拟程序包[1],它被设计成尽可能多地利用GPU的计算效能。除了普通的分子动力学模拟的功能外,它被发展成为一个可以针对高分子体系进行粗粒化分子动力学模拟的工具。它包含了一些最新报道的模拟技术,比如杂化粒子场分子动力学方法[2]、反向迭代波尔兹曼数值势方法[3]、软的各向异性粒子模型[4]、以及链增长聚合反应模型等[5]。中国化学会高分子学科委员会、中国化学会计算机化学专业委员
本文将团购行为纳入非线性定价的经济学范畴,通过综述前沿文献对消费群组(GPO)的理论研究,运用委托-代理模型及动态博弈中声誉效应,从经济动机上解释了第三方GPO可能出现的问题,并以此为依据,指出建立和...
在GPU上进行多片元效果的绘制,已有的方法往往需要对模型进行多遍的数据读取,以进行片元的有效排序.由于往GPU传输数据的带宽限制,多遍的数据读取严重制约了绘制效率的提高.虽然,随着CUDA的出现,已有...
针对Reax FF MD模拟煤热解反应机理存在的模拟计算效率和化学反应分析能力缺乏这两个关键问题,本课题组提出将GPU(graphics processing unit)高性能计算与化学信息学分析相结...
粒子模拟是研究离散粒子和连续介质运动规律的常用方法。而大规模的粒子模拟通常借助高性能计算系统。近年来,得益于其众核架构,图形处理器(GPU)已成为高性能计算的重要设备,并被广泛用于大规模粒子模拟过程的...
在日趋复杂的图形处理任务的推动下,GPU已经演化成为具有众多计算核心、计算能力强大的通用计算设备,并被越来越多地应用于图形处理之外的计算领域。GPU具有高并行、低能耗和低成本的特点,在数据并行度高的计...
近年来,GPU在通用计算方面对传统的CPU应用发起了强有力的冲击,被广泛运用于各种高性能计算中,特别是网络安全领域。为了解决传统硬件加速存在的缺陷问题,首先介绍GPU的基本硬件架构及其并行计算原理,其...
图形处理器(GPU)可编程性能的不断提高使得在三维几何造型系统中出现了越来越多的基于GPU的应用.提出了一个基于GPU片元程序计算B样条曲面的加速算法.通过测试算法在GPU上计算B样条曲面的时间与基于...
近年来GPU作为一种具有极强运算能力的多核处理器,得到了快速的发展,成为高性能计算领域的主要发展方向。各种分子动力学模拟的主流软件也纷纷使用GPU技术,其中LAMMPS较早地开发出了通用的并行GPU版...
この論文では,ビデオ映像に含まれる振動成分を取り除くための処理の計算をGPU を用いて行う手法を提案する.映像の安定化処理には,グローバルモーションの推定,振動補正,モザイキングの3 つの処理を行うが...
背景:抗葡萄糖6磷酸异构酶(GPI)抗体在K/Bx N小鼠模型中起到致关节炎作用,大部分类风湿关节炎( RA)患者血清中存在高浓度的抗GPI抗体。目的:探讨血清GPI水平在 RA筛查诊断中的意义,以及...
CT图像重建具有高计算密集性、高并行性、大数据量的特点,特别适用于单指令多线程并行操作的流处理架构,图形处理单元正是基于这样架构的一种硬件。本文基于消息传递接口与CUDA混合编程,实现了多个图形处理单...
通用目的图形处理器(GPGPU)在高性能计算(HPC)领域正得到越来越多的重视和应用。Mole-8.5作为世界上首套使用NVIDIA Tesla C2050的GPGPU超级计算系统,在颗粒流、多相流等...
本文采用格子Boltzmann方法(LBM)在图形处理器(GPU)上计算了由静止圆柱阵列组成的团聚物周期单元内的不可压缩流体流动,流固交界面处采用直接反弹以实现无滑移边界,每个圆柱上的曳力通过统计动量...
本发明公布了一种针对GPU程序的源码级数据传输能耗估算方法,包括如下步骤:基础参数测量计算:针对具体的CPU+GPU异构体系平台单机系统,进行系列基本测量,标定程序状态相关的基本参数;其中,需要测量的...
本文采用格子Boltzmann方法(LBM)在图形处理器(GPU)上计算了由静止圆柱阵列组成的团聚物最小周期单元内的不可压缩流体流动,流固交界面处采用直接反弹以实现无滑移边界,每个圆柱上的曳力通过统计...
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针对Reax FF MD模拟煤热解反应机理存在的模拟计算效率和化学反应分析能力缺乏这两个关键问题,本课题组提出将GPU(graphics processing unit)高性能计算与化学信息学分析相结...