Jurnal Filsafat terbit lagi setelah pada tahun 2005 untuk tiga volume tidak terbit. Tidak terbitnya Jurnal Filsafat terkait dengan dilakukannya restrukturisasi pengelola dan pengelolaan. Mulai volume 39, nomor 1, April 2006 dan seterusnya, tampilan Jurnal Filsafat mengalami perubahan. Perubahan tersebut secara substansial tidak merubah identitas Jurnal Filsafat. Perubahan tersebut berupa penambahan ilustrasi pada sampul dengan dicantumkannya kata “Wisdom” dan gambar beserta katakata bijak seorang filsuf sebagai ikon; dengan penambahan tersebut dimaksudkan agar Jurnal Filsafat senantiasa menampilkan artikel ilmiah filsafati yang membawa hikmah. Jurnal Filsafat, untuk volume 39 ini, terbit dalam rangkaian suasana mengenang satu abad kelahiran...