Phylogenetics of water buffaloes revealed by polymorphism of the mitochondrial D-loop region

Die Phylogenese der Wasserbüffel (Bubalus bubalis) wird noch immer kontrovers diskutiert. In der Vergangenheit variierte die Divergenzzeit zwischen Fluß- und Sumpfbüffeln, je nach Analysemethode, zwischen 10.000 und 1,7 Mio. Jahren. Um ein besseres Bild zu erhalten, wurde die komplette mitochondriale D-loop Region von 80 Büffeln aus vier verschiedenen Rassen analysierten. Im einzelnen waren dies 19 Sumpfbüffel (Carabao) und 61 Flußbüffel (Murrah, Jafarabadi und Mediterraneo). Die Länge der D-loop Region variiert aufgrund von Längenpolymorphismen an drei Positionen zwischen 925 und 929 Basenpaare. 36 mitochondriale Haplotypen mit 128 polymorphe Positionen wurden identifiziert. Da innerhalb der Flußbüffel keine rassenspezifischen Polymorphismen gefunden wurden, berechneten wir die paarweise Sequenzdivergenz (unkorrigier