Diversité des espèces de Fusarium isolées du maïs fourré du Royaume-Uni et structure de la population de F. graminearum provenant du maïs et du blé

International audiencePre-harvest contamination of forage maize by mycotoxin producing Fusarium species was investigated in the UK in 2011 and 2012. A total of 15 Fusarium species were identified from a collection of 1,761 Fusarium isolates recovered from maize stalks and kernels. This study characterized the diversity of Fusarium species present in forage maize in the UK. The predominant species detected were F. graminearum (32.9%) and F. culmorum (34.1%). Along with those species; F. avenacem, F. cerealis, F. equiseti, F. langsethiae, F. napiforme, F. oxysporum, F. poae, F. proliferatum, F. scripi,F. solani, F. subglutinans, F. tricinctum and, F. verticillioides were occasionally isolated. The trichothecene genotypes for F. graminearum were determined to be 84.9% deoxynivalenol (DON) and 15.0% nivalenol (NIV) while F. culmorum isolates were determined to have 24.9% DON and 75.1% NIV genotypes. A Bayesian model-based clustering method with nine variable number of tandem repeat markers was used to evaluate the population genetic structure of 277 F. graminearum isolates from the maize and wheat in the UK. There were three genetic clusters detected which were DON in maize, NIV in maize and DON in wheat. There were high admixture probabilities for 14.1% of the isolates in the populations. In conclusion, increased maize production in the UK and the high admixture rates in a significant portion of F. graminearum populations in maize and wheat will contribute to a new pathogen population which will further complicate breeding strategies for tolerance or resistance to this pathogenin both crops.La contamination préalable du récolte du maïs fourrager par des espèces de Fusarium produisant des mycotoxines a été étudiée au Royaume-Uni en 2011 et 2012. Au total, 15 espèces de Fusarium ont été identifiées à partir d'une collection de 1 761 isolats de Fusarium récupérés à partir de tiges de maïs et de noyaux de maïs. Cette étude a caractérisé la diversité des espèces de Fusarium présentes dans le maïs fourrager au Royaume-Uni. Les espèces prédominantes détectées étaient F. graminearum (32,9%) et F. culmorum (34,1%). Avec ces espèces; F. avenacem, F. cerealis, F. equiseti, F. langsethiae, F. napiforme, F. oxysporum, F. poae, F. proliferatum, F. scripi,F. solani, F. subglutinans, F. tricinctum et F. verticillioides ont parfois été isolés. Les génotypes de trichothécène pour F. graminearum ont été déterminés comme étant 84,9% de désoxynivalénol (DON) et 15,0% de nivalénol (NIV), tandis que les isolats de F. culmorum étaient déterminés à avoir 24,9% de DON et 75,1% de génotypes de NIV. Une méthode de regroupement bayésienne basée sur le modèle avec neuf nombres variables de marqueurs répétitifs en tandem a été utilisée pour évaluer la structure génétique de la population de 277 F. isolats de graminearum du maïs et du blé au Royaume-Uni. Il y avait trois grappes génétiques détectées qui étaient DON dans le maïs, la NIV dans le maïs et le DON dans le blé. Il y avait des probabilités de mélange élevées pour 14,1% des isolats dans les populations. En conclusion, l'augmentation de la production de maïs au Royaume-Uni et les taux de mélange élevés dans une partie significative des populations de F. graminearum dans le maïs et le blé contribueront à une nouvelle population de pathogènes qui compliquera encore les stratégies de sélection pour la tolérance ou la résistance à ce pathogèneDans les deux cultures