Diversidade genética da raça garrana baseada em MTDNA, microssatélites e dados genealógicos

Tese de mestrado, Biologia (Biologia da Conservação), 2007, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasA presente dissertação refere-se a uma raça autóctone portuguesa que se encontra em risco de extinção, o Garrano. Para esta raça é essencial um plano de gestão que vise o seu melhoramento genético e salvaguarda a longo prazo. Através de uma componente molecular (DNA mitocondrial e microssatélites) pretendeu-se analisar a variabilidade genética e estrutura populacional dos indivíduos que entraram a título inicial para os núcleos mais característicos da raça: Arcos de Valdevez, Vieira do Minho e Terras de Bouro. Por outro lado, usando o Livro Genealógico da raça e com recurso ao programa Sparks, procurou-se informatizar os dados genealógicos, bem como realizar a análise genética e demográfica da raça com base nestes. Em ambos os marcadores moleculares a raça Garrana evidenciou variabilidade alta e baixos valores de inbreeding. Desta forma, a principal preocupação para a conservação desta raça é o seu reduzido efectivo. A análise de haplótipos do DNA mitocondrial revelou quatro haplogrupos já anteriormente descritos para outras raças de cavalos e novos haplótipos que realçam a singularidade da raça. Verificou-se a existência de estruturação populacional com Arcos de Valdevez a distinguir-se dos outros dois. Este, de acordo com a Associação de Criadores de Equídeos da Raça Garrana, foi constituído por animais de carácter menos puro. Esta raça possui um registo genealógico completo até à segunda geração. Com a transferência desses dados para um programa informático, ficou instituída uma ferramenta de grande utilidade na gestão da raça. No sentido do seu melhoramento genético e diminuição da perda de variabilidade genética deve-se promover a contribuição equitativa dos fundadores, que neste estudo se revelou desequilibrada. Os baixos valores de Inbreeding obtidos e os diversos parâmetros demográficos, calculados com base no pedigree, poderão encontrar-se enviesados, consequência da pouca profundidade e lacunas de informação deste registo genealógicoThe present dissertation is about an autochthonous Portuguese horse breed in danger of extinction, the Garrano. It is essential a management plan to achieve genetic improvement and make a long term maintenance of this breed Through molecular approach (mitochondrial DNA and microsatellite), the genetic diversity and population structure of the first individuals of the most characteristic nucleus of this breed (Arcos de Valdevez, Vieira do Minho e Terras de Bouro) were analyzed. Moreover, informatization of genealogical data and demographic and genetic analyses using Garrano's Stud Book and software Sparks were conducted. In both molecular markers this breed showed high levels of variability and low values of inbreeding, which means that the main concern about Garrano is the low number of effectives. The analysis of mitochondrial DNA haplotypes revealed four haplogroups already described for other horse breeds and it also revealed new haplotypes, that emphasizes the singularity of this breed. Is evident the existence of a population structure, with Arcos de Valdevez being apart from the other two nucleus and according to Associação de Criadores de Equídeos da Raça Garrana this was the nucleus which initiated with the less pure animals. This breed possesses a complete genealogical record until second generation. With the insertion of the data in a software is implemented a very relevant tool for population management. To improve genetically and minimize the loss of variability, the founder must have and equilibrated contribution, which was not the case of Garrano. Low values of inbreeding and several other determined parameters, using pedigree data, may not be completely correct because of low profundity and lacuna of dat